Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RPAP2Q8IXW5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms