Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms