Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKL3Q8IVW4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms