Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms