Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC84Q86UT8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms