Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
OTOP1Q7RTM1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms