Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
USP43Q70EL4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms