Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GDF6Q6KF10 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms