Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EEF1DP3Q658K8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EEF1DP3Q658K8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms