Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf135Q5VTT2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf135Q5VTT2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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C9orf135Q5VTT2 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C9orf135Q5VTT2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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