Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
STRIP1Q5VSL9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
STRIP1Q5VSL9 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms