Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC93Q567U6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms