Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UVSSAQ2YD98 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms