Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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