Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC142Q17RM4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC142Q17RM4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC142Q17RM4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC142Q17RM4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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