Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYT16Q17RD7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 391.3 ms