Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
IMPG1Q17R60 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms