Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RBBP7Q16576 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms