Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TAF11Q15544 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms