Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYCP1Q15431 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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