Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PCOLCEQ15113 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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