Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NCAPHQ15003 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCAPHQ15003 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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