Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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