Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SCARF1Q14162 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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