Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms