Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTCH1Q13635 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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