Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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