Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PLD1Q13393 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PLD1Q13393 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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