Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SGCGQ13326 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCGQ13326 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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