Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TRAF1Q13077 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF1Q13077 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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