Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BNIP1Q12981 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms