Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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