Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LTBQ06643 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LTBQ06643 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms