Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SORDQ00796 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SORDQ00796 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms