Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HBBP68871 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
HBBP68871 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
HBBP68871 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HBBP68871 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms