Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVK-24P63145 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms