Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLR2FP61218 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms