Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HADHBP55084 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HADHBP55084 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 899.5 ms