Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA2D1P54289 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms