Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSRP3P50461 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSRP3P50461 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSRP3P50461 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSRP3P50461 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSRP3P50461 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSRP3P50461 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSRP3P50461 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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