Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNTAP49354 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms