Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI2P48788 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TNNI2P48788 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TNNI2P48788 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms