Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KRT6CP48668 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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