Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TMPOP42166 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TMPOP42166 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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