Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PCSK1P29120 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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