Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLR2AP24928 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms