Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRKCHP24723 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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