Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VAMP1P23763 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms