Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BCKDHBP21953 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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