Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRHP20396 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRHP20396 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 BCAR1P1-201ENST00000553953 636 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRHP20396 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRHP20396 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRHP20396 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms